Метод кариотипирования клеток крови позволяет получить информацию о хромосомных нарушениях. Клетки лимфоцитов в норме не подвергаются последующим клеточным делениям. В присутствии митогена лимфоциты стимулируются к вступлению в митоз за счет репликации ДНК. Через 48-72 часа в культуру добавляют ингибитор для остановки митоза на стадии метафазы. После обработки гипотоническим раствором, фиксации и окрашивания хромосомы можно исследовать под микроскопом и оценить на наличие аномалий.
В поздней профазе или прометафазе митоза хромосомы более длинные и менее конденсированные. После G-бэндинга хромосомы демонстрируют более высокий уровень разрешения полос, не наблюдаемый при обычном анализе. Высокое разрешение позволяет более детально анализировать кариотип.
Культуры можно синхронизировать путем добавления метотрексата (МТХ), ингибитора биосинтеза тимидина, который блокирует клетки в S-фазе (синтез ДНК) клеточного цикла. Через 16-18 часов большая часть делящихся клеток в культуре находится в S-фазе. Если к культуре добавить тимидин, блок МТХ снимается, и клетки синхронно переходят к митозу, после чего можно добавить колцемид. Очень короткая обработка колцемидом в сочетании с этим методом может быть использована для получения удлиненных прометафазных хромосом при подозрении на небольшие делеции или перестройки.